طبق ماده یک قانون جامع کنترل و مبارزه ملی با دخانیات، ترکیب اعضای ستاد کشوری کنترل و مبارزه با دخانیات به شرح زیر است: 
- وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی - رییس ستاد 
- وزیر فرهنگ و ارشاد اسلامی 
- وزیر آموزش و پرورش 
- وزیر بازرگانی 
- فرمانده نیروی انتظامی 
- دو نفر از کمیسیون بهداشت و درمان مجلس شورای اسلامی به عنوان ناظر 
- رییس سازمان صدا و سیمای جمهوری اسلامی ایران به عنوان ناظر
- نماینده یکی از سازمان‌های غیردولتی مرتبط با دخانیات به انتخاب وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی 
- دبیرخانه ستاد در وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی مستقر خواهد بود. 
- گزارش عملکرد شش ماهه ستاد به هیأت وزیران و کمیسیون بهداشت و درمان مجلس شورای اسلامی ارائه می‌شود.
حال که وزارت بازرگانی با وزارت صمت ادغام شده است. سوال این است: آیا نماینده وزارت صمت در جلسات ستاد حضور می‌یابد؟
- نماینده یکی از سازمان‌های غیردولتی مرتبط با دخانیات (که در لیست اعضای ستاد آمده است) از کدام نهاد و سازمان است؟
- و آیا منظور قانون گذار نماینده صنعت دخانیات است یا نهادهای مرتبط با منع مصرف دخانیات؟
به نظر می‌رسد برخی اختلاف نظرها درخصوص آمار تولید، آمار قاچاق و جهت‌گیری‌های یکسویه علیه صنعت دخانیات ناشی از عدم حضور نمایندگان صنعت در ستاد کشوری کنترل و مبارزه با دخانیات باشد.  طبق تماسی که خبرنگار توتون صنعت با وزارت صنعت، معدن و تجارت داشت از دعوت آن وزارتخانه به جلسات ستاد اظهار بی‌اطلاعی شد.